Este museu documenta as diferentes culturas que, da pré-história à atualidade, se desenvolveram na região. Encontra-se instalado no Real Mosteiro de Nossa Senhora da Conceição, edifício fundado na segunda metade do século XV. A coleção deste museu é composta por património arqueológico dos períodos Romano, Visigótico, Árabe e Medieval, possuindo uma das mais notáveis coleções visigóticas do país. Reúne ainda pintura portuguesa, referentes ao período entre os século XV e XVIII; cerâmica; azulejaria; numismática; ourivesaria; escultura e arte sacra.